以前所属していた会社では一時期、FeliCa対応リーダー/ライターをPCに取り付けてedyをタイムカードとして使用していました。
edyが出始めの頃で、リーダーにて読み取りにくかったり、月２度の頻度で不具合が発生していたため3ヶ月で普通のタイムカードに戻りました。

その後オフィス移転のタイミングで、セコムの入退出＋タイムカードが導入されました。部屋の前でカードをかざし、出退勤時にはそのカードをタイムレコーダにかざしておりました。

利用者としての立場でしたので、コストやメリットはわかりかねます。

現在は紙のシートをタイムレコーダに差し込むタイプでしょうか？
私はそれでもかまわないと思います。
ＩＣカードを考えるならもう１つは機能を付けるべきと思います。
たとえば　社員食堂の料金精算、特定部署（たとえばコンピュータルーム）の入退室記録、．．．　もう１つの要望がないなら無理にＩＣカード化しなくてよいです。
御社の大きさ（従業員数、面積など）がわかりませんので具体的な事は言えませんが　製品紹介などは　アマノさんに頼めば一杯提案してくれるでしょう。