正直、途中の文面が分かりませんが、、、
良くあるパターンだと思うので同じような経験の方は多いと思います。
ただし、すでに並行稼動されているようなので
一旦新システムの稼動を止めて仕切り直す以外にはないと思います。

ERPですが使われている企業が多いことからも使えない　ということは
ないと思いますし、「使えない」ということであれば
使い方、設計どちらかが大きく誤っているのでしょう。
元々使いやすいシステムを作るためのものではないので
ある程度の使いづらさは残るかもしれませんが
再度「使えるもの」にしてから使うしかないでしょうね。
今のまま使いつづけても深みにはまるばかりでせっかくのものも
有効に使えないままになってしまいますよ。

ちなみにrobertさんの会社のような感じで無理して使ったばかりに
相当期間上手く行かなかった会社を知っています。
その会社ももう少ししっかりしたものにしてから使えばよかった
と思っているようですよ。

「はっきりいって全く使えません」というところに興味があるのですが、
どこが使えないのでしょうか？
○AP社のＥＲＰとは　有名な　ＳエーっとＰ社でしょうか？
それも　Ｒ３からＢ１などランクがあります。
どれもそれなりに良くできたという感想を私は持っています。
（聞いた話ではＲ３は何億円もするので導入したところはどこも「失敗した」とは恥ずかしくて言えずに、よって成功率１００％だとか）

同じような経験では
１０年以上前に外部からとんでもない役員が来まして、
ちょうどシステムの更新時期でしたのでその役員が無茶苦茶な
仕様を言いだして　その通りに作ったらまったく使えずに
結局、その部分は全部すてて作り直したことがあります。
机上の空論だったのでシステム屋は反対したのですが
強引に推し進めた結果、現場では使えないものになりました。