こんにちはです。
弊社もサーバは2003と異なりますが、同様の現象が出て調べた事があります。
そのURLに誘導出来れば良いのですが、どこだったのか覚えていませんので、
その時取得した内容をコピペします。（すいませんです。）
＜コピペ＞-------------------------------------------------------
基本的にActive Directory配下にコンピュータを登録した際には自動的にActive Directoryサーバ
の時刻と同期する様に設定されます。
しかし何らかの原因で時刻対象サーバ（タイムサーバ）の設定が欠落する場合があります。
その場合は下記の方法にて手動復帰してください。

１）同期の確認
　　コマンドを発行して、適切に同期出来るか確認します。
　　『w32tm /resync』
２）同期対象サーバとの差異を確認
　　同期対象サーバ（ドメイン）との差異がPCより確認出来るかを確認します。
　　『w32tm /monitor /domain:ドメイン』
３）同期対象サーバの設定
　　対象サーバを設定します。
　　『net time /setsntp:ドメインサーバ』
４）同期サービスの停止
　　時刻同期サービスの再起動の為に、一旦停止させます。
　　『net stop w32time』
５）同期サービスの開始
　　同期サービスを起動させます。
　　『net start w32time 』
６）手動同期の開始
　　設定した値にて時刻を手動で同期させます。

　　『w32tm /resync』

弊社の場合は、これで解決しました。
ご参考まで・・・

投稿番号No.1446 Windowsサーバーの時刻誤差

投稿番号No.1426 ウイルスのような挙動

も参考になるかと思います。

すぐに疑うのは　リチウム電池が切れてない？　ですが　「切れてない」かな？