当社では、クライアントにはWSUSを適用していますが、サーバーは導入当初のままです。

サーバーの場合、何か問題がない限りはUPDATEを行わないつもりです。
UPDATEせいで、いろいろとさらなる問題を引き起こす可能性があるので。（ミドルウェアとの問題など）

一応昨年仮想化環境にしたので、スナップショットをとって確認しながら作業出来るかもしれませんが、やっぱり怖くてサーバーのUPDATEは出来てません。

台数次第ですが、
弊社の場合3桁のサーバ数あるので・・・
SCCM入れてます。。。
http://www.hitachi-solutions.co.jp/ms-solutions/sp/solution/sccm/
ご参考になれるとうれしいです。

ウチはもっと横着してまして

・サーバはトラブルといやなので自動更新しない
　ベンダーに聞くとサーバはアップデートしないほうがいいですよ　というところもあるので　あながち間違いではないかと
・クライアントも自動更新しない　
　アナウンスを聞かずに自動更新のままにしているクライアントは大抵はトラブります。　Javaが上がって動かない、ＩＥが１０になって基幹システムが動かない、文書管理ソフトはなんとＩＥ６まで対応で　　ドラッグ＆ドロップでの投稿も出来ないし、［互換表示］にしないと表示もくずれたままという情けない状態です。

お疲れ様です。

うちもベンダーからUPDATEをかけないように指示されています。
私は前任者に聞いただけだったため、いつかベンダーにUPDATEをかけない理由を確認しようと思っていたのですが、
皆さんのコメントを拝見すると結構UPDATEされないところも多いのだなと納得できました。

ほぼ同じような運用をしています。

WSUSでの自動配布の対象に Server は含めています。ただし、SQL Server 周りは自動では問題があるため、WSUSの自動配布対象から外しています。（本当は 特に重要な SQL Sever をセットアップしているサーバーグループを作成して、そこだけを配布対象外にすれば良いのですが…）

WSUSからアップデートは自動的に配布されますが、Updateの適用、適用後の再起動は手動です。アップデート配布から１週間後から作業開始、２週間後までのアップデート完了を目途に順次作業しています。

理想論としてはコメント（2）の方のように、SCCMなどで運用するのが望ましい事はわかっていますが、そこまでの予算は無理な状態が続いています。

役に立つ解決策が無くてすみません。

Server を Update するかどうかに関しては、積極的に Update をする方針で運用しています。「Update をしないリスク」と「Update をするリスク」を考えた場合、「Update をしないリスク」の方が大きいとの判断のためです。（過去にアップデートされていない一部クライアントPCでのウイルス感染があったため、その時から上記方針で運用しています）（担当役員への説明も行っています）