以下のページにKB3161949を当てた後の対処法の記載がありますよ。
直接レジストリを修正しろとあるから、ハードルは少し高いかも。。。
[MS16-077] WPAD 用のセキュリティ更新プログラム (2016 年 6 月 14 日)
ーインストール後の動作の変更
https://support.microsoft.com/ja-jp/kb/3165191
リコー製の複合機は対策しましたね。
セキュリティパッチによりローカルサブネット外のNETBIOS通信の仕様に変更があったということですね。
しばらく前から悩んでいた事が解決したのでメモとして残しておきます。
状況
拠点に設置された富士ゼロックス製ネットワークスキャナ(DocuScan C4260)から
本社内のWindows Serverへの画像転送に失敗する。
失敗の理由はユーザー認証の失敗。
WANを経由しない本社内のスキャナでは不具合は起きない。
原因
6月15日に配信された更新プログラムKB3161949が原因、削除する事で解決。
マイクロソフトの解説
[MS16-077] WPAD のセキュリティ更新プログラムについて (2016 年 6 月 14 日)
https://support.microsoft.com/ja-jp/kb/3161949
ローカル サブネット外の NETBIOS 通信が強化されます。そのため、既定では、NETBIOS に
依存する一部の機能 (NETBIOS を介した SMB など) がローカル サブネットの外部で機能し
なくなります。
ユーザーの情報
2016年6月のWindows Updateの不具合&トラブル情報
http://freesoft.tvbok.com/cat97/2016/2016_06_windows_update.html