Ｏｕｔｌｏｏｋからの設定で　「圧縮する」にチェックを入れるかどうかのことですか？
そうであれば　何人も使ってますが　支障は出ていません。
個人用フォルダが大きくなりそうなら入れればいいと思います。

Ｏｕｔｌｏｏｋ２００３以降は２Ｇ以上のｐｓｔも作れるようになりました。
個人用フォルダ作成時に選択できます
圧縮可能な暗号化も選択できます

outlook98の頃から.pstファイルの圧縮をあらゆる環境で
百数十回してきていますが、何回かトラブルに遭遇しています。

大抵は私の操作確認上のミスですが・・・。

１．ディスク空容量を確認しないまま圧縮してしまった。
２．ネットワーク越しの.pstファイルに対して圧縮してしまった。
３．outlookのプラグインの形で組み込まれるウィルス検知駆除ソフトを
　　一時的に無効にしないまま圧縮してしまった。
　　プラグインとは、通常のsmtp/pop3を監視してのウィルス検知駆除を
　　指しているのではなく、.pst内のオブジェクト単位でウィルス検知
　　駆除をしてくれる機能を指しています。

いずれも圧縮中に止まると運悪いと泣きをみます。

outlookを終了させた上でひとまず.pstファイルのバックアップコピーを
作成し、上のことを確認して圧縮してください。