「５人家族の家を建て直すのですがいくらくらいかかるでしょうか」と聞かれている気分です。

「バージョンアップだから安くやれよ」
「カスタマイズもそのまま動くのじゃないのかね」
「まえの担当は「簡単に出来ます」と言っていたぞ」
「データベースの移行はこっちでやるからさっ引いておけ」
「今度もボロ儲けするつもりじゃないだろうな」
「そんなに高いんじゃまかせられないな　他の業者をあたるぞ」
「ハードはおまけにしてほしいなあ」
などベンダーとネチネチと交渉してみましょうよ。

ソフトウェアやそちらの体制などがわからないことだらけなので一概にいえませんが・・
プラットホームとミドルウェアだけのリプレースで済みそうなのであれば
自力（もしくは半自力＝ベンダーにある程度サポートしてもらう）でやっちゃうというのもアリかもです。
ただ、テストは入念にしたほうがいいと思いますが。

当たり前、かつちょっと無責任なアドバイスかもしれませんが、ご容赦を！