お疲れ様です。

tencnetで少し調べてみたのですが、差分/増分に対するコメントは特に記載がないように思われます。

あくまでも移行ツールですから、移行した後に移行前のツールを利用するというのは、想定されていないのではないでしょうか？

どうしても移行後に移行前PCを利用する場合は、移行後にできたファイル等はUSBメモリで保存するとかファイルサーバー保存する等の運用的回避が必要ではないかと思います。

ご検討ください。