ウチ（弊社）はIMPA4なので「サーバーにメッセージのコピーを置く」ということをしていません。

メールサーバはなんなのでしょうか
OutlookはもともとはExchangeサーバのクライアントですがOutlook＜＞ExchangeサーバはIMPA4なので Outlookには「サーバーにメッセージのコピーを置く日数」の設定は無いのではないでしょうか。
同様にADのグループポリシーにも無いのではないかと。

POP3メールで「サーバーにメッセージのコピーを置く日数」は各人によって違うので（ ＰＣが１台ならコピーを置かない、ＰＣが３台なら最も使わないＰＣが何日ぶりに使うかで決まってくるでしょう）グループポリシーには向かない（＝グループポリシーで決めることではない）という気がします。

POP3でOutlookを使ったことがないのでハズしているかもしれません。

該当するレジストリのキーは
[HKEYCURRENTUSER\Software\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Windows Messaging Subsystem\Profiles<profilename>\9375CFF0413111d3B88A00104B2A6676<00000002>]
にあるLeave on Serverです。
一見ランダムな値が入っているように見えますが固定値のようです。
(WEBで検索するとヒットします)
GPで直接レジストリを変更するような操作をすればお望みのことが出来そうです。もしくはログオンスクリプトで設定値を書き換えるプログラムを実行するなどでしょうか。