■そのモデルを選択した理由
これは、Vistaのどのエディションを選択するかで変わってくると思います。
家庭向けのモデルでは、「Home」しか選択できませんし、企業向けでも「Business」「Ultimate」が選択出来る場合もありますし、モデルによっては選択できない場合もあります。

一応、原則的に、購入時期ごとに異なったメーカー／モデルを選択して購入していくと、後々の管理が面倒になります。
私の会社では、ここ最近は「Dell/OptiPlex」で固定させていますが、他のメーカーでも企業向けのモデルを選択すれば、長期的に同じモデルを購入する事が可能なはずです。

■どのエディションがいいか、使っているか
最低でも「Business」、予算が許せば「Ultimate」と言うところでしょうか？
ちなみにまだ評価段階です。

■特定のソフトウエアが動作しなくて困っている
「Symantec Client Security」は現時点で未対応です。
「Adobe Acrobat 8」も、動作はするようですが、正式には未対応です。

上記が未対応のため、現状では検証も優先度が下がっています。上記の対応を確認した後、本格的な検証を進める予定です。

以上、ご参考になれば幸いです。